Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLKQ9UBE8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLKQ9UBE8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLKQ9UBE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLKQ9UBE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLKQ9UBE8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms