Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCHIP1Q9P0W5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCHIP1Q9P0W5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCHIP1Q9P0W5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.7 ms