Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A1Q9NY26 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A1Q9NY26 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A1Q9NY26 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A1Q9NY26 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A1Q9NY26 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC39A1Q9NY26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms