Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGPEP1Q9NXJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGPEP1Q9NXJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms