Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHL11Q9NVR0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHL11Q9NVR0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHL11Q9NVR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL11Q9NVR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLHL11Q9NVR0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms