Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7J1

PPP1R3E, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3EQ9H7J1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3EQ9H7J1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R3EQ9H7J1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R3EQ9H7J1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1R3EQ9H7J1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1R3EQ9H7J1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms