Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NXF3Q9H4D5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NXF3Q9H4D5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NXF3Q9H4D5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NXF3Q9H4D5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NXF3Q9H4D5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF3Q9H4D5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NXF3Q9H4D5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NXF3Q9H4D5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NXF3Q9H4D5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXF3Q9H4D5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms