Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIOBPQ9H2D6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIOBPQ9H2D6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIOBPQ9H2D6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIOBPQ9H2D6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIOBPQ9H2D6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIOBPQ9H2D6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms