Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CADM1Q9BY67 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CADM1Q9BY67 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CADM1Q9BY67 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CADM1Q9BY67 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CADM1Q9BY67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms