Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RSG1Q9BU20 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RSG1Q9BU20 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RSG1Q9BU20 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSG1Q9BU20 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms