Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYT17Q9BSW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SYT17Q9BSW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SYT17Q9BSW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SYT17Q9BSW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SYT17Q9BSW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SYT17Q9BSW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms