Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLF1Q9BQI6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
SLF1Q9BQI6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLF1Q9BQI6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLF1Q9BQI6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLF1Q9BQI6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLF1Q9BQI6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLF1Q9BQI6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms