Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VRK1Q99986 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VRK1Q99986 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VRK1Q99986 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VRK1Q99986 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VRK1Q99986 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms