Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPN18Q99952 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPN18Q99952 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN18Q99952 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPN18Q99952 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN18Q99952 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN18Q99952 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms