Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV6

HIST1H2AA, Histone H2A type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AAQ96QV6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST1H2AAQ96QV6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST1H2AAQ96QV6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIST1H2AAQ96QV6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST1H2AAQ96QV6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIST1H2AAQ96QV6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms