Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf85Q96MD7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf85Q96MD7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf85Q96MD7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf85Q96MD7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf85Q96MD7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf85Q96MD7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf85Q96MD7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms