Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC74BQ96LY2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC74BQ96LY2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74BQ96LY2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74BQ96LY2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC74BQ96LY2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74BQ96LY2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms