Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITCHQ96J02 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITCHQ96J02 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITCHQ96J02 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms