Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIPA1Q96FS4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIPA1Q96FS4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIPA1Q96FS4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIPA1Q96FS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIPA1Q96FS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIPA1Q96FS4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIPA1Q96FS4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIPA1Q96FS4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms