Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OTUB2Q96DC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OTUB2Q96DC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTUB2Q96DC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTUB2Q96DC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUB2Q96DC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUB2Q96DC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms