Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L1Q96BA8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CREB3L1Q96BA8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L1Q96BA8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB3L1Q96BA8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269 ms