Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MKL1Q969V6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MKL1Q969V6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MKL1Q969V6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MKL1Q969V6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MKL1Q969V6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MKL1Q969V6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKL1Q969V6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKL1Q969V6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MKL1Q969V6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms