Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABGGTAQ92696 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABGGTAQ92696 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RABGGTAQ92696 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RABGGTAQ92696 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGGTAQ92696 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABGGTAQ92696 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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