Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP28Q8NHY6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZFP28Q8NHY6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZFP28Q8NHY6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFP28Q8NHY6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP28Q8NHY6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms