Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF3Q8N9W5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF3Q8N9W5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF3Q8N9W5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNAAF3Q8N9W5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNAAF3Q8N9W5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms