Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCD7Q8N8D1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCD7Q8N8D1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDCD7Q8N8D1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCD7Q8N8D1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCD7Q8N8D1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms