Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MSL3Q8N5Y2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MSL3Q8N5Y2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
MSL3Q8N5Y2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MSL3Q8N5Y2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MSL3Q8N5Y2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MSL3Q8N5Y2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MSL3Q8N5Y2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms