Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TCP11L2Q8N4U5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TCP11L2Q8N4U5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TCP11L2Q8N4U5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TCP11L2Q8N4U5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TCP11L2Q8N4U5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TCP11L2Q8N4U5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TCP11L2Q8N4U5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms