Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NINQ8N4C6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NINQ8N4C6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINQ8N4C6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NINQ8N4C6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms