Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLX4Q8IY92 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLX4Q8IY92 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLX4Q8IY92 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SLX4Q8IY92 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SLX4Q8IY92 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SLX4Q8IY92 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SLX4Q8IY92 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SLX4Q8IY92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLX4Q8IY92 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SLX4Q8IY92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLX4Q8IY92 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLX4Q8IY92 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SLX4Q8IY92 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms