Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIX1LQ8IVB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIX1LQ8IVB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIX1LQ8IVB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIX1LQ8IVB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIX1LQ8IVB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms