Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LDLRAD3Q86YD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDLRAD3Q86YD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LDLRAD3Q86YD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LDLRAD3Q86YD5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms