Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM69Q86WT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM69Q86WT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM69Q86WT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM69Q86WT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM69Q86WT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM69Q86WT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms