Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCA5Q86VQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCA5Q86VQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LCA5Q86VQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LCA5Q86VQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCA5Q86VQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms