Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00299Q6ZSB3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00299Q6ZSB3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00299Q6ZSB3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00299Q6ZSB3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms