Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH9

PAMR1, Inactive serine protease PAMR1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAMR1Q6UXH9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAMR1Q6UXH9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAMR1Q6UXH9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAMR1Q6UXH9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAMR1Q6UXH9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAMR1Q6UXH9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAMR1Q6UXH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAMR1Q6UXH9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAMR1Q6UXH9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAMR1Q6UXH9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAMR1Q6UXH9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAMR1Q6UXH9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms