Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL4

KLHL24, Kelch-like protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL24Q6TFL4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL24Q6TFL4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL24Q6TFL4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL24Q6TFL4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL24Q6TFL4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL24Q6TFL4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms