Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL13AP3Q6NVV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL13AP3Q6NVV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL13AP3Q6NVV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms