Protein–RNA interactions for Protein: Q6DT37

CDC42BPG, Serine/threonine-protein kinase MRCK gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPGQ6DT37 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDC42BPGQ6DT37 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDC42BPGQ6DT37 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDC42BPGQ6DT37 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDC42BPGQ6DT37 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDC42BPGQ6DT37 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CDC42BPGQ6DT37 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDC42BPGQ6DT37 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDC42BPGQ6DT37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDC42BPGQ6DT37 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDC42BPGQ6DT37 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CDC42BPGQ6DT37 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDC42BPGQ6DT37 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDC42BPGQ6DT37 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms