Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RSBN1Q5VWQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSBN1Q5VWQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSBN1Q5VWQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RSBN1Q5VWQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RSBN1Q5VWQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms