Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGO1Q5FBB7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGO1Q5FBB7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGO1Q5FBB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGO1Q5FBB7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGO1Q5FBB7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms