Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF542PQ5EBM4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF542PQ5EBM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF542PQ5EBM4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF542PQ5EBM4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF542PQ5EBM4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF542PQ5EBM4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF542PQ5EBM4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF542PQ5EBM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF542PQ5EBM4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF542PQ5EBM4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF542PQ5EBM4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms