Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZC3H12AQ5D1E8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZC3H12AQ5D1E8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZC3H12AQ5D1E8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZC3H12AQ5D1E8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZC3H12AQ5D1E8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms