Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC93Q567U6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC93Q567U6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC93Q567U6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC93Q567U6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC93Q567U6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC93Q567U6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC93Q567U6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms