Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC23Q53EV4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC23Q53EV4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC23Q53EV4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC23Q53EV4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC23Q53EV4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC23Q53EV4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.3 ms