Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP221Q4G0U5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP221Q4G0U5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP221Q4G0U5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP221Q4G0U5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP221Q4G0U5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms