Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRTAP21-3Q3LHN1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRTAP21-3Q3LHN1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRTAP21-3Q3LHN1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRTAP21-3Q3LHN1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRTAP21-3Q3LHN1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms