Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLPPQ16740 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPPQ16740 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPPQ16740 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLPPQ16740 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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