Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ECM1Q16610 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ECM1Q16610 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ECM1Q16610 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ECM1Q16610 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM1Q16610 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM1Q16610 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM1Q16610 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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