Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMCHL1Q16048 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PMCHL1Q16048 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMCHL1Q16048 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PMCHL1Q16048 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms